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Paris, Pasteur, Pili
A propos de moi :
Je m’appelle Theis Jacobsen et je suis originaire du Danemark où j’ai terminé en Décembre 2018 mon Master en biochimie des protéines. En Janvier 2019, j’ai débuté ma thèse à l’Institut Pasteur. Je suis né et ai grandi sur une île du sud du Danemark appelée Langeland. Langeland est approximativement 2.7 plus grande que Paris intramuros, mais sa population est seulement de 12 mille personnes, ce qui est peu comparé aux 2,1 millions de parisiens. Il existe des différence importantes quand je compare les conditions de vie de mon enfance à celles de ma situation actuelle à Paris. Depuis Septembre 2013, je vivais avec ma compagne dans la capitale du Danemark, à Copenhague, où j’étudiais ma Licence et mon Master.
Mon chemin jusqu’à ViBrANT et Paris:
Pendant la finalisation de mon mémoire de thèse, j’ai reçu un email qui m’était transféré, venant de Michael Nilges de l’Institut Pasteur. Dans ce message, il était indiqué qu’un poste
de doctorant était disponible et à pourvoir avec un très court délai. J’ai candidaté pour cette thèse, ai passé l’entretien d’embauche et ai été sélectionné pour réaliser cette thèse. Après avoir débuté mon travail, j’ai appris ce qu’était vraiment ViBrANT et qu’un long processus de recrutement avait été en cours depuis longtemps avant mon arrivée. Parmi les choses que j’ai manquées, il y a eu une réunion de démarrage où tous les ESRs et directeurs se sont rencontrés et ont commencé le processus que j’ai maintenant rejoint avec un peu de retard. Même si j’ai parfois eu le sentiment d’être en retard par rapport aux tâches qui m’étaient confiées, je sens maintenant que je suis presque au fait de la plupart de mes devoirs. Mon début à l’Institut Pasteur a été une expérience très agréable où tout le monde a été accueillant. Tous mes collègues m’ont aidé lorsque j’en avais besoin, notamment pour remplir les formulaires administratifs français, m’installer dans mon nouveau laboratoire ou me familiariser avec cette ville présentant une culture et une langue qui m’étaient étrangères.
Le projet scientifique et son environnement :
Mon institution hôte est l’Institut Pasteur qui a été fondé par Louis Pasteur après qu’il ait développé le vaccin contre la rage, qui fut une énorme avancée pour la médecine moderne. Pasteur était un génie scientifique et il a largement contribué à la connaissance, entre autres, dans le domaine de la fermentation microbienne et bien sûr celui de la pasteurisation. L’Institut Pasteur est localisé dans le centre de Paris et accueille jusqu’à 2500 employés, étudiants et chercheurs. La pertinence scientifique de l’Institut Pasteur est soulignée par le fait qu’elle a accueilli 10 scientifiques différents qui se sont vus attribuer le prix Nobel depuis la fondation en 1887.
L’objectif de mon projet de thèse est de déterminer la structure du pili de type IV provenant d’Escherichia coli entérohémorragique en combinant différentes techniques de biologie structurale. En résumé, les pili sont des filaments protéiques situés à la surface des cellules qui jouent un rôle important dans la motilité, la pathogénicité et l’adhésion aux cellules hôtes. Les pili sont composés de différentes sous-unités protéiques qui sont assemblées dans la membrane de la bactérie. Ces protéines s’appellent des pilines. Les pilines sont divisées en deux sous-catégories: les pilines majeures et les pilines mineures. Les pilines majeures constituent la plus grande part des sous-unités incorporées dans les pili, alors que les pilines mineures sont beaucoup moins présentes. On pense néanmoins qu’elles sont importantes pour l’initiation de la formation des pili. Ma thèse poursuivra les travaux précédemment effectués dans le laboratoire où la structure de la piline majeure ppdD d’Escherichia coli entérohémorragique a été résolue par RMN. Cette structure de sous-unité a été combinée avec une carte de densité du pilus entier obtenue par cryo-micrcosopie électronique, ce qui a permis de déterminer la structure quaternaire du pilus. Mon projet de thèse se concentrera sur les pilines mineures pour déterminer leurs structures, leurs interactions et leurs localisations dans les pili. Ainis nous pourrons déterminer l’architecture complète des pili bactériens d’E. Coli entérohémorragique. Ces résultats vont servir pour développer des stratégies de thérapie et de vaccin.