Read this blog in:

• 
• 
• 
• 
• 

Ryhmän A streptococcus pyogenesin ja ihmisen plasmaproteiinien vuorovaikutusten kartoitus

Miksi ryhmä A Streptococcus pyogenes?

 Ryhmä A Streptococcus pyogenes (GAS) on ihmiselle spesifinen bakteeri; aiheuttaen erilaisia ​​vaikutuksia ihmisissä aina paikallisista infektioista invasiivisiin infektioihin. Kaasun tiedetään aiheuttavan kurkkukipua / nieluntulehdusta, mutta se voi myös aiheuttaa ihmisille hengenvaarallisia ja vakavia vaikutuksia, kun se pääsee verenkiertoon. Yksi invasiivisen GAS-infektion vakavista oireista on sepsis.

 

Invasiivisten bakteerien torjumiseksi ihmisen immuunisolut vapauttavat kemikaaleja verenkiertoon infektion etenemisen hallitsemiseksi. Mutta joskus kehon reaktio näihin kemikaaleihin infektion aikana (myös GAS-tartunnan tapauksessa) menee hallitsematta, mikä johtaa kehon eri osien tulehdukseen, joka johtaa sepsikseen. Vakava sepsis voi johtaa septiseen sokkiin, jossa ihmisen verenkiertoelimet kärsivät, aiheuttaen siten epänormaalia verenpaineen laskua ja johtaa yksilön kuolemaan.

 

Lancet (av Rudd et al. 2020) julkaistun tutkimuksen mukaan maailmanlaajuisesti 48,9 miljoonaa ihmistä kärsii sepsiksestä ja noin 11 miljoonaa kuoli sepsiksestä mikä on melkein yksi viidestä kuolemasta. Joten sepsistä on pidettävä vakavana ihmiskunnan uhkaavana sairautena, kuten mitä tahansa muuta tautia, kuten syöpää.

 

Tietoja GAS: sta

GAS: n tärkein virulenssitekijä on M-proteiini. M-proteiini on pintaproteiini, joka on kovalenttisesti kiinnittynyt bakteerien pintaan ja ulottuu noin 500 Ä bakteerien ulkopuolelle. Se on järjestetty samansuuntaisessa alfa-spiraalisessa muodossa, mikä aiheuttaa tiheän kerroksen bakteerien ulkopuolella. Joskus M-proteiini vapautuu myös bakteerin pinnalta. M-proteiineilla on hypervariaabelialue, joka johtaa M-proteiinien eri versioihin, mikä aiheuttaa erilaisia ​​GAS-serotyyppejä. Erilaisten M-proteiinien perusteella tähän päivään mennessä on raportoitu lähes 220 GAS-serotyyppiä.

 

Minun roolini

Jatkan tutkimusta Lundin yliopiston biolääketieteellisessä keskuksessa (Johan Malmströms). PhD-projektini perustuu tähän tappavaan ihmisen patogeeniin. Yritän projektissani vastata kysymykseen siitä, mikä helpottaa näiden bakteerien selviämistä ihmisen veressä? Koska proteiinit ovat rakennuspalikoita kaikille eläville organismeille, ymmärrän kuinka bakteerit selviävät ja aiheuttavat siksi tartunnan ihmisessä, joten keskityn ymmärtää näiden M-proteiinien ja ihmisen plasman välistä vuorovaikutusta. Tärkein tekniikka, jota käytän tavoitteeni saavuttamiseen, on massaspektroskopia. Massaspektrometria on instrumentti, jota käytetään laajalti proteiinien tunnistamiseen missä tahansa mielenkiinnon kohteena olevassa näytteessä. Kuten aiemmin sanottiin, M-proteiinista on erilaisia ​​versioita, jotka aiheuttavat erilaisia ​​GAS-serotyyppejä, joten olen valinnut muutama M-proteiini. Olen ilmaissut nämä proteiinit yhdistelmäversiona ja puhdistaneet ne. Näiden rekombinantti-M-proteiinien puhdistaminen suoritettiin Oslossa siirron aikana Dirk Linken laboratoriossa alkuvuodesta 2019. Jotta ymmärrän vuorovaikutusta ihmisen proteiinien kanssa, käytän näitä yhdistelmä-M-proteiineja kokeisiin. Vetävien kokeiden jälkeen vuorovaikutteinen kompleksi analysoidaan massaspektrometrialla.

 Julkinen toiminta

Meillä oli yksi kandidaatin ja yksi maisteriopiskelija vierailemassa laboratoriossamme helmikuun alkupuolella 2020. Opiskelijat olivat laboratoriossa viikon ajan. Olen opastanut heitä ja auttanut heitä tekemään alasvetokokeita, valmistelemaan näytteitä massaspektrometriaa varten ja osoittamaan massaspektrometriaa ja sen toimintaa. Minulla oli myös esitys viime viikolla osastollamme; missä puhuin projektistani ihmisille laitoksen eri ryhmistä. Lundilla on kaunis katedraali kaupungin keskustassa -Lunds Domkyrka. Myös Lundin lähellä on joitain rantoja. Tässä on joitain kuvia vierailuni aikana katseltavaksi, kunnes nautit niistä itse, kun olet Lundissa toukokuussa. Odotan innolla ViBrANT-tiimin vierailua Lundissa toukokuussa !!